原因有很多：

第一，左宗棠在战前做了充足的准备。

众所周知，左宗棠是在1876年（光绪二年）4月，肃州祭旗正式出兵，打响了收复新疆之役。不过，在这之前，左宗棠耗费了很长时间、动用了大量资源做了两件准备工作。

第一件是为西征大军准备足够的粮草。左宗棠当即派出自己的亲信大将、“嵩武军”统领张曜率领一支军队前往哈密屯田，并调拨了3万两银子，作为屯田大军的启动资金。张曜不负众望。他到达哈密后，身先士卒，带领部队寻找水源，烧林开荒，不到一年时间，就开荒2万多亩，当年喜获丰收，一共收获粮食100万斤，能够供应张曜的部队达两个月之久。实验性屯田取得了成功，左宗棠又陆续出动军队在各地进行屯田。这些军队也都取得了成功。不仅如此，左宗棠还下令，鼓励当地老百姓参与到屯田中来，这种屯田叫民屯，与部队的军屯有所区别。但他们的作用是一样的，就是积极发展农业生产，提高粮食产量。

第二件事是创办兰州制造局，为西征军制造大量先进武器装备。左宗棠在兰州畅家巷，以搬迁到此地的西安机器制造局部分设施设备为基础，创建了兰州机器制造局。兰州机器制造局是西北地区第一个近代军工企业，左宗棠寄予了极大的厚望。他特地从福州机器局调来赖长，担任兰州机器制造局的总办，全权负责运行。兰州机器制造局除了赖长，还远远不够。左宗棠又从南京金陵制造局和上海江南制造局高薪“挖”来一批技术精湛的专业技师和工匠，请他们协助赖长工作。兰州机器制造局的技术能力很强大。他们能够仿造出普鲁士螺丝炮、后膛七响枪以及英国马蒂尼步枪等先进武器，还能够自行设计研发新式武器——包括一种二百多斤的重炮。

第二，左宗棠收复新疆的军队很厉害。

很多人以为左宗棠收复新疆的军队是冷兵器时代的旧式军队战斗力很弱，但是实际上恰恰相反，左宗棠统率的六万清军是当时东亚比较强大的近代军队之一。

步枪：左宗棠在收复新疆时，清军装备了包括德国M1871型毛瑟步枪在内的多种先进武器。M1871型毛瑟步枪是当时德国采用的最好的步枪，清朝在1876年向毛瑟公司订购了26000支1871型毛瑟步枪。这是毛瑟公司建以来的第一份出口订单。这款步枪奠定了毛瑟步枪帝国的基础。

机枪：此外，左宗棠的军队还装备了加特林机枪，其每分钟200-600发。而这种武器俄军是到了第二年也就是1877年的俄土战争才用上，这更不要说是阿古柏了。再加上普鲁士后膛炮以及开花炮弹的应用，极大的震撼了俄国人和阿古柏。

（加特林机枪～格林十管机关炮）

加特林比较重，需要很多人操作，所以左宗棠进行了改装↓

第三、阿古柏的军队并没有那么强。

阿古柏手中的军队仍然保留中亚军队的传统风格。其核心是浩罕人（安集延人），兵力可分为杰吉特（骑兵）、沙尔巴兹（步兵）、托普奇（炮兵）和抬枪兵，扩充大批本地人之后，其兵力上限为3.6万人，配备60门火炮。此外还有“不大可靠，装备很差，军纪很坏”的东干民兵（Дунганскаго ополчения）约1万人。

阿古柏起事之初颇为倚仗阿富汗军人，其近卫军（红沙尔巴兹）即为阿富汗式军队，与英印当局打通关系后从印度顺来了英国条令，但掌控多数部队训练方式的则是土耳其教官。除近卫军使用阿富汗语（不知是达里语°还是普什图语？）发号施令外，其余步兵使用土耳其语。

所以导致阿古柏的步兵和骑兵均以二列横队队形为基础，在日常训练和演习中使用方阵、横队和纵队队形。其训练条令是阿富汗、英国和土耳其方式的杂糅产物，并且土耳其的教官修养、知识均不够，人手也短缺。导致步兵、炮兵训练状况颇为低劣。

此外，其军中枪支颇为混杂。数目最多的单兵火器仍是火绳枪，击发枪数量仅次于火绳枪，其中恩菲尔德线膛击发枪约8000支，燧发枪并不多。此外通过土耳其﹣英国渠道获得约4000支连发枪，连发枪似乎是以恩菲尔德改造成的斯奈德（士乃德）为主。

第四、阿古柏的政权不得人心。把能得罪的都得罪了。

首先，阿古柏打南疆，是一路屠杀过去的，连当地的官员都不放过。

打下了南疆后，也没有着手恢复当地秩序，而是继续横征暴敛。

高额的税收+强制征兵，把农民阶级得罪了。

限制贸易+盘剥商人，把商人阶级得罪了。

对寺庙收税，把宗教阶层也得罪了。

军政也搞得一坨大便，导致出现大规模逃兵。他手下的各类官员，也各种圈钱跑路。

阿古柏的强制征兵，连外国人都抓去了。

第五、战略作战

利用英俄矛盾，先北后南，缓进急战，缓进为筹饷精兵，急战为速战速决，在英俄介入前，击败阿古柏，迅速掌握主动权。

第六、抱有必死决心。

第二次进疆，抬棺进军武力威胁俄罗斯吐出崇厚签的丢掉伊犁的条约。