通化市自然资源比较丰富，是一座天然资源丰富的立体宝库。通化市有2/3以上的面积为山区（属长白山系）。南部是鸭绿江与浑江之间的老岭山区，中部是浑江与辉发河之间的龙岗山，北部为低山丘陵区（海拔最高的老岭山脉东老秃顶子为1,589米，最低海拔集安市凉水朝鲜族乡杨木村为108米），是山地和平原的过渡地带。地势由南向北沉降，形成南高北低的地势地貌。同时，通化市的气候又具有比气温正常稍低，降水稍多，日照时数偏少的特点（全年平均气温为0.5℃，比常年低0.3℃；降水量为920毫米，比常年多139毫米；日照时数为2155小时，比常年少203小时）。由于具有上述这些独特的地理结构，大自然为通化市造就了丰厚的天然财富资源。
通化市森林资源丰富，是吉林省重点林区之一。2014年通化市林地总经营面积为1317321公顷，林地面积为97201.54公顷，占总经营面积的73.7%。有林地面积为877291.9公顷，占林地面积的66.6%。全市森林覆盖率为67.03%。森林立木总蓄积6621.1万立方米，野生经济植物共13科，约1000余种。其中，人参产量占全国的40%，绿色食品资源190余种，野生经济动物有100多种，全市总经营面积为1530793公顷。
药物资源有植物药、动物药和矿物药，是全国“五大药库”之一。已经查明的药物资源252科、596属、1133种，主要有人参、天麻、贝母、五味子、红景天等；野菜资源主要有蕨菜（蕨菜又叫拳头菜、猫爪、龙头菜。蕨菜野生在林间、山野、松林内，是无任何污染的绿色野菜，不但富含人体需要的多种维生素，还有清肠健胃，舒筋活络等功效）；薇菜（薇菜为蕨类植物紫萁的嫩叶柄，又名紫箕，俗称大巢菜、野鸡头、扫帚菜，属紫箕科多年生草本植物）；蒲公英；桔梗（多年生草本植物，根可入药,有止咳祛痰、排脓等作用）和各种菌类蘑菇等190余种野生植物。还有林蛙、蜂蜜、花粉、天然色素和矿泉水等资源。
通化市境内江河纵贯流通，水利资源十分丰富。境内还有河流千余条，分归鸭绿江、松花江水系。最大河流有鸭绿江、浑江、辉发河。中朝界河鸭绿江流经通化市至辽宁省丹东市入黄海，境内流长203.5公里，流域面积3.2万平方公里。浑江流经白山、通化、桓仁、集安汇入鸭绿江，流域面积4371平方公里。辉发河系属松花江水系主要支流，沿龙岗山脉东北流向，经柳河、梅河口、辉南、桦甸入松花江，境内流长112公里，流域面积1.04平方公里。水资源总量29.37亿立方米。辖区有大型水库1座，积水面积548平方公里；中型水库10座，积水面积1070.32平方公里；小型水库295座；池塘9006个。丰富的水利资源促进了通化市水利经济的发展。全市商品鱼产量15370吨，其中养殖产量14240吨，捕捞产量1130吨。鱼种生产1121吨，鱼苗生产3亿尾。
另外，通化市的矿产资源也比较丰富。黑色金属、有色金属、贵重金属、非金属和能源矿产在境内分布较广。矿产资源已经发现82种，探明储量46种，列入储备表的有23种。
通化市是吉林省东南部和东北地区东部最大的区域经济中心城市。近年来，通化市紧紧抓住交通条件历史性改变的机遇，立足沈阳经济圈进入东北东部门户和东北东部经由丹东出海枢纽的战略地位，大力培育批发市场、建立物流中心，建设连接沈阳经济圈与东北东部地区商贸物流中心城市。着眼于满足区域内外的多样化、多层次消费需求，在加快建设开放通道、畅通人流物流，统筹规划建设住宿餐饮购物娱乐等基础设施、加快提升城市综合服务功能的同时，全面促进休闲度假消费、购物消费、文化娱乐消费、体验消费，推动商贸服务业又好又快发展。
目前，欧亚购物中心、义乌小商品城、中东新天地购物公园已开业投入运营，长白山医药物流中心、龙湾会馆、高力休闲餐饮文化城建设正在火热进行中，通丹、梅沈高速公路和通丹铁路建设快速推进，营抚高速公路竣工通车，通靖高速公路即将开工，通长高速公路可研上报交通部、国家发改委，通集高速公路通过省审批，通化机场开工，通化陆港奠基，交通的大发展，“蓝天工程”已经全面完成，商贸物流正在实现由传统业态向新型业态转变，为全市商贸经济发展带来了无限活力，取得了积极进展和丰硕成果，不仅提高了通化市的辐射能力，而且还进一步拓宽了通化市与外部交流、合作的渠道，为打造东北东部地区中心城市奠定了坚实的基础。
通化市已经成为吉林省第三大城市、东北地区第十大城市，被列为全国数字地理空间框架建设试点城市，素有“人参之乡”“中国中药之乡”“优质大米之乡”“葡萄酒之乡”“滑雪之乡”和“中国松花砚之乡”的“六乡”之美誉。目前，通化市获得的荣誉主要有：“中国公益明星城市”“全国双拥模范城”“中国人居环境奖（水环境治理优秀范例城市）”“中国百佳投资城市”“中国特色魅力城市”“中国市民最满意城市”“中国松花砚之乡”“中国人参产业基地”“国家新型工业化医药产业示范基地”“国家科技兴贸出口创新基地”“中国通化葡萄酒城”“中国医药城”“中国旅游竞争力百强城市”“中国特色魅力城市”“中国十佳休闲宜居生态城市”“中国十佳投资创业城市”“中国十佳宜游城市”“中国第一医药城”。
