左宗棠深知新疆是中国领土不可分割的一部分，“吾之疆索，尺寸不可让人”，这种强烈的国家领土意识和爱国情怀，是他收复新疆的精神支柱。他认为老祖宗打下的江山，一寸也不能丢，即使面临重重困难和压力，也坚决要收复新疆，这种坚定的信念让他在艰难的情况下始终保持着高昂的斗志。 左宗棠为了收复新疆，不惜付出一切代价。他不顾自己年事已高，亲自率军，抬棺西征，以表示自己视死如归的决心和收复新疆的坚定信念。这种大无畏的精神激励了自己的部下。

阿古柏的势力主要集中在南疆，北疆势力相对薄弱。左宗棠根据这一情况，制定了“先北路后南路”的战略方针。先进军北疆，不仅可以先声夺人，还能解除进击南疆时的后顾之忧。 缓进急战的战术原则，“缓进”是指不匆忙进兵，提前做好充足的准备，包括军队的训练、武器装备的准备、粮草的筹集等。“急战”则是指当军事行动开始时，要速战速决，避免陷入持久战的泥潭。

充分考虑了新疆的气候、粮运、防务、交通等因素，使清军能够在最短的时间内取得最大的战果。 左宗棠对西征军进行了裁减和精选，裁汰冗杂，将一部分战斗力较弱的兵勇转为农垦劳力，节省了军饷和军粮，同时提高了军队的战斗力。 收复新疆需要大量的军费，而清朝国库空虚，无法提供足够的资金。左宗棠通过向朝廷申请拨款、地方协饷、向商人借贷等方式，筹集了大量的军饷，确保了战争的顺利进行。据统计，左宗棠为新疆战事所筹集的资金接近3000万两白银。 左宗棠开辟了四条路线购买和运输军粮，包括从甘肃河西采购、经蒙古草原运输、在新疆东部采买以及向俄国人购买等，缓解了粮食的急用，为军队的长期作战提供了保障。

为了应对阿古柏的洋枪洋炮，左宗棠在兰州建立了“兰州制造局”，请来了熟练工匠，大量制造先进的武器，使清军的武器装备水平得到了很大的提高。 沙俄本来也觊觎新疆，但见阿古柏占了大部分地方，感到很不爽。左宗棠主张跟沙俄缓和关系，沙俄也顺势跟清廷缓和了关系，在一定程度上减轻了清军收复新疆的外部压力。 阿古柏在新疆的统治十分残暴，各族人民对阿古柏政权恨之入骨。左宗棠收复新疆的行动得到了新疆各族人民的支持和拥护，他们为清军提供了情报、物资等方面的帮助，为清军的胜利做出了贡献。