明治天皇亲政

明治元年（1868年）正月三日，朝廷派遣奉币使到伊势神宫。明治元年正月十三日，朝廷派奉币使到神武天皇、天智天皇、光格天皇、仁孝天皇、孝明天皇的山陵奉告明治天皇要举行元服典礼一事。明治元年正月十五日，明治天皇举行元服典礼。

明治元年正月十七日，大久保利通上奏朝廷，建议迁都大阪，引起朝廷的热议。明治元年二月三日，明治天皇颁布新政命令。之后，明治天皇到大阪视察海军，了解关东的形势。明治元年二月二十八日，明治天皇来到学问所，召集在京大名共商国是。明治元年三月十四日，明治天皇来到南殿，率领众位公卿、大名在天神地祗前盟誓，约五事。这就是有名的五条御誓文，其大致内容是：“其一，广兴会议，万机决于公论；其二，上下一心，盛行经纶；其三，公武[3]一途直至庶民，人心不倦；其四，基于天地公道，打破旧来陋习；其五，振作皇国基础，求知识于世界。”

明治元年三月二十日，明治天皇在南殿祭祀军神。明治元年三月二十三日，明治天皇来到大阪，将西本愿寺作为行在。明治元年（1868年）三月二十六日，明治天皇到天保山海面视察海军。因德川庆喜已经归顺朝廷，明治天皇回京，在学问所处理国家大事。明治元年八月二十七日，明治天皇在紫宸殿举行即位大典，赏赐群臣酒肴。明治元年九月八日，朝廷下令实施一代天皇一个年号的制度。八月二十六日是明治天皇的生日，朝廷诏告天下定这一天为天长节，每年为明治天皇贺寿。

明治元年七月十七日，朝廷把江户改称东京。明治元年九月二十日，明治天皇从京都出发，前往东京视察。岩仓具视、中山忠能、伊达宗城、木户孝允、山内丰积等陪同前往。明治元年（1868年）十月十三日，明治天皇抵达东京，将江户城作为皇宫。岩仓具视建议明治天皇回趟京都，为孝明天皇举行三周年忌，并举行立皇后的仪式。朝廷批准了这一建议。明治元年十月二十二日，明治天皇回到京都。

明治元年十月二十八日，藤原氏入宫，被立为皇后。当天，朝廷举行了立后仪式。藤原氏并非皇族，却被立为皇后，并且当天就举行立后仪式，这还是第一次。明治元年十一月十二日，明治天皇参拜伊势神宫。明治元年十一月二十八日，明治天皇回到东京。此后，东京成为日本的首都。

明治政府的财政、外交及官制

财政问题和外交问题是德川幕府覆亡的两大原因。明治政府成立后，财政问题和外交问题依然最棘手。为了解决财政困难，明治政府发行纸币。当时，人们不信任纸币，导致财政越来越困难。于是，明治政府下令各藩国用金币、银币与纸币兑换，又让富豪协助政府的会计工作。尽管如此，明治政府的财政依然吃紧。明治天皇发行纸币的初衷是让纸币和金币、银币同价。在市场上可以进行纸币和金币、银币的交易，而纸币的信用很低。投机商趁机从中赚取差价，导致市场很混乱，给物价带来了重大影响。明治政府治理金融市场，改革货币制度，在此基础上进行地租改革，建立了租税制度，使财政工作逐渐走上正轨。

早在德川庆喜归还政权以前，外交问题已经告一段落。对于明治政府来说，解决财政问题是当务之急。在奥羽等地发生叛乱之际，各国公使宣布局外中立。岩仓具视、东久世通禧到横滨和英国、法国、荷兰、美国、意大利、普鲁士六国公使进行会谈。在国内统一、形势趋稳之后，明治政府让各国公使解除了局外中立状态，并与各国建立了外交关系。

明治政府成立以来，不断改革官制。明治元年闰四月，明治政府将太政官分为议政、行政、神祗、会计、军务、外务、刑法七个部分，分别掌管立法、行政、司法三权。明治政府在地方上设立府、藩、县，在府、县设立知事，藩依然按照旧制。朝廷内部及地方上还不稳定，需要统一政令。朝廷任命萨摩藩的西乡隆盛、长州藩的木户孝允、土佐藩的板垣退助、佐贺藩的大隈重信为参议，指导各个部门的工作。在参议的任命上，朝廷煞费苦心，照顾到了各藩国的平衡。

版籍奉还与废藩置县

明治二年（1869年）正月二十三日，毛利敬亲、岛津忠义、锅岛直大、山内丰范联名上书朝廷，表示愿意将领地和领民归还朝廷。对此，朝廷答复说：“天皇陛下将再次到东京。届时，朝廷会召开会议，讨论此事并做出决定。希望你们仔细调查版籍之后再交还朝廷。”

当时，各个藩国一直在讨论归还朝廷版籍问题。木户孝允此前已经就此提过建议。伊藤博文任兵库县知事时，就讨论过姬路藩归还朝廷版籍的问题。在这种情况下，各藩国纷纷上表，请求归还朝廷版籍。朝廷曾一一下达指令。然而，地方上分为府、藩、县三类，制度不同，要进行统一绝非易事。

“明治维新三杰”西乡隆盛、大久保利通、木户孝允经过磋商，决定实施废藩置县，进行大规模的行政改革。三条实美、岩仓具视也同意实施废藩置县。明治四年（1871年）七月四日，明治天皇来到小御所，召集萨摩藩、长州藩、土佐藩、肥前藩的知事，命令他们协助实施废藩置县改革。接着，朝廷召集肥后藩、尾张藩、鸟取藩和在京各藩的知事入宫，宣布免去他们藩知事的职务，并向各国使节通知了这件事。南部的长冈藩等两三个藩上奏朝廷，请求废藩置县。由于种种原因，其他各藩还没有主动提出废藩置县的请求。后来，明治政府采取各种措施敦促其他各藩响应朝廷号召，最终在全国范围内实施了废藩置县。至此，日本全国得以统一，明治维新的大业最终实现。