文宗咸丰帝之前，大清常备武装力量分为八旗军和绿营军，他们各自有一套指挥体系。绿营军最高长官是提督，下辖总兵、游击等等，直到最低级的把总。而八旗军所设立的官员与绿营官员只管军务不同的是，还管理所属地旗人的一些行政事务，再就是称呼不同。

八旗满洲、蒙古、汉军的最高长官称为都统，设1人，入关前称固山额真，设左右梅勒额真2人。入主中原以后的顺治十七年（1660年），从汉语，固山额真改为都统，从一品，梅勒额真改为副都统，正二品。都统掌一旗的户口、官爵承袭、教养、军事训练等。清代全国共设都统衙门24处，各省都统辖八旗兵在2000以上。

副都统掌镇守险要、安定军民、均衡政刑、修举武备等。另外设将军的地区，一般不设都统，只有副都统。所以在某些地区，副都统即为一地驻防八旗军长官。

职位在副都统之下的官员称为协领，正三品，负责驻防旗之一旗军政事务，也是军政一体式官员。被大清视为龙兴之地的东北地区，协领有独处一城领驻防者，如拉林、珲春、三星等地。

参领和协领品级一样，都是正三品，副参领为正四品。参领管的事比较杂，因此京城每旗下分5位参领，主要为掌管上三旗包衣（满洲贵族世仆）事务，编审包衣丁口名册，领发俸银军饷以及养膳、赏赐和抚恤钱粮，办理文武生童考试事宜，挑选三旗包衣披甲，稽查世职谱系，查禁逃人，以及训练操演，值宿宫禁担任警卫等。

城守尉是八旗驻防将领官名，全国共设城守尉衙门16个，正三品，由副都统管辖，不过开封、太原、保定、沧州四地则为单独率兵驻守。城守尉带兵一般为数百人，少则百余人，个别地方也有超过千人的。具体使命为负责重要府州防卫，掌管驻防八旗兵军务，修举武备，整治安定地方。

佐领为正四品，驻京师者置于参领之下，驻地方则置于协领之下。战时佐领为统兵将官，清初太宗皇太极在位时带兵200人，康熙年间带兵130至140人，嘉庆年间带兵150人。佐领平时为行政官员，掌管所属户口、兵籍、田宅、诉讼诸事。

骁骑校为八旗基层编制单位副长官，设于佐领之下，也是骁骑营武官，正六品。每佐领下设1人，计满洲681人，蒙古204人，汉军266人。骁骑校职责是协助佐领管理所属户口、兵籍，以及骁骑营操练、守卫等事务。

领催是低总军职，满洲、蒙古、汉军八旗各佐领下均有设置，从马兵识字者中挑选。八旗满洲、蒙古军领催带兵6人，八旗汉军领催带兵4人，主要工作是登记档案以及支领粮饷等诸般军务。