然而，在2016年，武警黄金部队经历了职能的重大调整。其任务重心从传统的“为国寻金”转向了军事地质服务等新的领域，更多地关注与国家安全战略和军事需求相关的地质勘查活动，为国防建设提供有力的地学支持。
到了2018年，武警黄金部队迎来了更深层次的体制改革。该部队不再归属于中国人民武装警察部队领导管理，而是转为了非现役专业队伍，并整体划入自然资源部进行统一管理。这一转型后，武警黄金部队的工作重心转变为承担国家基础性、公益性的地质工作任务，涵盖了地质灾害应急救援、重要区域地质调查等多个方面，以更加专业、高效的方式服务于国家经济社会发展大局，为其提供科学、精准的地质技术支持。
