1935年5月，经过四渡赤水、巧渡金沙江后，红军算是真正把长征以来一直尾随的蒋军甩掉了，这无疑和遵义会议后，中央重新让毛主席掌握军队指挥权有很大的关系。
5月上旬，红3军团包围了四川会理，并在那里进行了几天的休整。趁着这个休整的机会，毛主席决定梳理一下过去一段时间内部发生的问题。
什么问题呢？《聂荣臻回忆录》记载：
四渡赤水以后到会理会议期间，在中央红军领导层中，泛起了一股小小的风潮，算是遵义会议后一股小小的余波。遵义会议以后，教条宗派主义者们并不服气，暗中还有不少活动。忽然流传说毛泽东同志指挥也不行了，要求撤换领导……
这显然是一个大问题。
5月12日，中央通知彭德怀、杨尚昆等人到会理城郊参加政治局扩大会议，规定下午2点前务必赶到。参加这次会议的，包括张闻天同志（当时主持中央工作），“军事三人团”的周总理、毛主席和王稼祥同志，中革军委的朱老总，以及一军团的负责人林、聂，三军团的负责人彭、杨（尚昆同志时任红三军团政委）。
当时红3军团正在围攻会理，但还没有打下来。因为军情紧急，这次会议只开了一天，但是这并不妨碍会理会议在红军历史上的重要性。
会议开始后，负责主持会议的张闻天在报告中肯定了毛主席的军事指挥，严厉批评了部分同志的消极情绪，并特别指出，林军团长给中央写的那封信是不对的。
林军团长在信中怀疑“军事三人团”的指挥，并提出应该让彭老总出任前敌指挥，迅速和四方面军会合。表现出了一种厌烦悲观的情绪。会理会议实际上就是围绕着这封信展开的。
杨尚昆之前因为腿伤躺了半个月的担架，并不知晓此事，看到信的内容后，他“才感到问题很严重”。
作为搭档，聂荣臻在会上说明了他所知道的情况：在给中央写这封信之前，林军团长就给彭老总打过电话，他作为政委，当时就表示了反对，但林军团长还是坚持自己的看法，以个人的名义给中央写了这封信。
中央同志于是问彭老总，彭老总说：“他打过电话，但我根本没有同意。”
聂荣臻在一旁做证：“他（指林）打电话时，我和左权、罗瑞卿、朱瑞都在旁边，他的要求被彭德怀回绝了。”
中央同志问彭老总：“你既然不同意，为什么不向中央汇报这件事呢？”
当时，主持中央工作的张闻天就在红三军团，彭老总确实可以向他汇报，但他并没有重视这件事，以为那不过是一段牢骚话，毕竟当时部队里这种情况确实比较常见。
杨尚昆回忆：“会上，毛主席非常生气，讲话很多……最有代表性的话就是：你是个娃娃，懂得个啥？在当时这种情况下，不走弓背走弓弦行吗？”
一直到40年代，杨尚昆才知道毛主席为何“发这么大火”，乃至对张闻天都提出了批评：
首先，自宁都会议失去指挥权到遵义会议重回军队，这中间已经过了三年。而毛主席复出的第一仗——土城战斗却因为前方情报失误没有得手。按理说，胜败乃是兵家常事，认真总结经验教训就好，“但是博古却嘲讽说：看来狭隘经验论者指挥也不成。”（杨尚昆的回忆引述）
可想而知，当时毛主席身上所背负的压力有多大。
其次，毛主席虽然重新获得了红军的指挥权，但在最初的一段时间，权威其实并不巩固。
最典型的例子就是，三渡赤水前，红一军团建议攻打打鼓新场的周浑元部，毛主席却认为，我们的主力要两天才能赶到那里，到时候滇军和黔军也去了，加上川军的策应，我们很容易得不偿失。
当时大多数同志都主张要打，毛主席的意见没有受到足够的重视。杨尚昆回忆说：“一位同志竟然说：少数服从多数，不干就不干。”这让毛主席颇为无奈。
最后，双方谁也没有说服谁，主持会议的张闻天按照少数服从多数的原则做出了打的决定。
当天晚上，毛主席思来想去，还是觉得不应该打，于是提着马灯找到了当时拥有“军事行动最后决策权”的周总理，要他晚一点下命令。经过周总理的居中调和和大家的再次讨论，中央采纳了毛主席的意见，让红军避免了一次不必要的损失。
在战场上，时间就是生命，需要决策者抓住时机，机断专行，如果大家在会上争论不休，决策迟迟不下，那么部队最终是要失败的。也就是在此次事件后，中央及时调整，决定以周总理、毛主席、王稼祥组成全权指挥军事的三人团。
在这之后，中央考虑到去年上海局遭到了严重的破坏，决定派潘汉年和中央的一位负责同志重回上海，恢复党在白区的工作，并设法恢复和共产国际已经中断了半年的联系。
当时，主持中央工作的张闻天同志就自告奋勇，表示自己愿意去。但大家都没有同意，最后派了陈云同志去，由此有了后来《陈云出川》的故事。
如果我们把上面这几件事串联起来，就可以看到：遵义会议后，毛主席刚刚出来担负重任不久，中央领导层和前线主要将领中，就有人嘲讽，有人怀疑，要人表示愿意离开红军去上海，有人要求改换军事领导人……
杨尚昆晚年写道：“这确实是相当严重的事情，毛主席所以恼火是可以理解的……这次会议克服了党内和部队内的涣散情绪，是有积极意义的。那个时候，如果上下动摇是很危险的。幸好开了这个会，问题很快得到了解决。”
会理会议结束后，中央在红军里也进行了一次思想整顿教育工作，将会理会议的精神进一步向下传达，由此为红军接下来长征的顺利奠定了更加坚实的基础。在接下来的日子里，红军将挥师北上，强渡大渡河，迅速向四方面军会合。
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