人体菌群研究的前世今生

晋云一 2024-03-31 02:12:14

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人体菌群研究的前世今生

了解自己的肠道菌群

1944年

第一次分离出人类相关的厌氧菌。培养厌氧菌

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在1944年对牛瘤胃中降解纤维素的微生物的一项研究中,Robert. E. Hungate革命性的滚管方法使厌氧菌的成功培养成为可能。这种沿用至今的培养方法,使人们第一次分离出人类相关的厌氧菌。

1958年

粪菌移植用于治疗艰难梭菌感染

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1958年,一项研究报道了使用粪便灌肠成功治疗伪膜性小肠结肠炎。之后,粪菌移植被广泛接受为可成功治疗复发性艰难梭菌感染的抢救疗法。

1981年

生命早期的菌群承递

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早在1900年,早期的研究就描述了婴儿体内细菌承递的各个方面,但在1981年,有三项研究着手于定量地表征肠道共生菌的早期获得,并研究了喂养如何塑造我们的初始菌群。

1996年

测序识别人类菌群

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1996年,研究者利用基于序列的方法,对人类相关菌群进行了鉴定。该研究使用16S核糖体RNA测序,分析了人类粪便样本中可培养和非培养细菌的多样性。

2006年

饮食-菌群相互作用对人体代谢的影响

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从2006年开始,许多研究都强调了饮食可以影响肠道菌群和宿主代谢,这对人类健康以及我们如何通过认识这些相互作用来开发基于营养的治疗方案,具有深远影响。

2007年

采用组学技术分析人类菌群功能

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Eline Klaassens及其同事使用宏蛋白质组学方法分析了非培养的粪便菌群,为菌群提供了第一个分类学鉴定之外的见解。之后,代谢组学和宏转录组学等组学技术被用于大量研究,这也促进了多组学实验分析流程的发展;这些方法目前仍在揭示菌群功能方面发挥重要作用。

2010年

生物信息学工具助力菌群测序数据分析

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以QIIME软件为代表的“菌群生态学定量分析”方法,使对菌群测序产生的海量数据进行分析及解释成为可能。

2011年

对大规模人群的菌群分析

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21世纪初,宏基因组及高通量测序技术的发展催生了多个分析大规模人群菌群多样性的项目。大规模人群研究极大地提升了我们对菌群多样性的认知,并发现了许多菌群与健康和疾病的潜在关联,激励了更多新研究的开展。

2012年

菌群-肠-脑轴

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2011年,一些实验发现缺乏菌群影响了小鼠的行为、脑基因表达及神经系统的发育。而近期一些人体研究正在揭示菌群与人神经系统之间的潜在关联

2018年

人体肠道菌群影响癌症治疗的应答

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在小鼠模型中的早期研究之后,最新研究发现肠道菌群组成影响了黑色素瘤患者、晚期肺癌患者及晚期肾癌患者对免疫检查点抑制剂治疗的应答及肿瘤控制。

2018年-至今

微生态疗法新时代

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从数字了解人体微生态系统

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从我们呱呱坠地到变为尘埃,微生物始终都陪伴在我们的身边,分布在我们的口腔、胃肠道、呼吸道、生殖道,甚至每一寸皮肤,与我们的身体之间相互作用,相互影响,构成了人体微生态系统。

10-100 trillion

每个人体内的共生微生物数量有10-100万亿,主要是肠道内细菌。

>10000

人体不同种类微生物的数量>10000

100:1

微生物的基因数量与人体基因数量之比约为100:1

22000

人类的基因数量接近22000个

99.9%

在人类基因组中,个体之间的基因相似程度为99.9%

90%

高达90%的疾病都可能与肠道以及微生物菌群的健康有关

10X

体外微生物的数量是人体细胞数量的10倍

3.3 million

人类肠道微生物的基因数量为330万

80%-90%

就人体微生物组而言,每个人体之间的差异在80%-90%

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晋云一

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