这是没有办法选择的。副科领导职务是单位的中层领导职务，在省辖市的机关，各个委办局属于正县级单位，科级属于各个单位的内设机构，晋升副科级领导职务是自己仕途发展的起点；四级主任科员是职级，对应副科级待遇。
在县乡机关中，哥部委办局和乡镇属于科级单位，副科级领导属于机关的副职领导。虽然副科级领导职务，是公务员法规定的领导职务中最小的官，但也是官，也是单位的领导，要管理和领导四级主任科员。
按照职务职级并行规定，公务员实行职务职级并行的管理制度，机关公务员既可以晋升领导职务，也可以晋升职级。职级不具有领导职责，担任职级的公务员依据隶属关系接受领导，履行相关职责。
从任用方式来看，只要在一级科员岗位上任职满二年，就有机会提拔为副科级领导职务。从一级科员到副科级领导职务，是人生进步的起点，也是担任领导职务中最重要的一步。对于那些有比较高的综合素质，具有领导才能的人，只要提拔为副科级领导职务，就标志着进入了领导班子序列，从此就可以不断取得进步，有的甚至可以平步青云，步步高升。
职级的任用方式是晋升，晋升和提拔是完全不同的两个概念，提拔是从下一级提拔到上一级，晋升虽然也有提拔的意思，但晋升是一种常规操作，只要符合条件，到点就可以晋升。虽然晋升的程序也比较复杂，和提拔几乎没有区别，但从一级科员晋升到四级主任科员，也只能是晋升。
按照职务和职级的对应关系来说，只要提拔为副科级领导职务，对应的最低的职级就是四级主任科员，既解决了职务提拔的问题，也解决了职级自然套改的问题。副科级对应的最高职级是三级主任科员。
在三级主任科员的晋升条件中，只要担任乡科级副职或是四级主任科员满2年，就有机会晋升三级主任科员。但如果是乡科级副职和四级主任科员条件相同，假如只能晋升一个人，担任乡科级副职的人，比较四级主任科员更有晋升优势。
当然按照职务职级与级别管理办法的规定，四级主任科员也可以晋升乡科级领导职务，而且担任四级主任科员两年以上的人，只要组织上认为有需要，有管理能力，可以从四级主任科员直接提拔为乡科级正职。
虽然有这样的规定，但各级组织部门在提拔人才时，往往会把更多的提拔机会给予那些担任过乡科级副职的人，四级主任科员职级提拔为乡科级正职的机会还是比较渺茫的。
如果在一个单位，同时有提拔乡科级副职的机会，也有晋升四级主任科员的机会，那么本人该怎么选呢？其实这没有必要选，估计百分之一百的人都会选择担任乡科级副职，有了乡科级副职这个头衔，今后进一步提拔领导职务，或是晋升职级，都比四级主任科员有更多的机会。
但这只是一种设想，在实际中基本上不存在这种机会。但有时单位有两个条件相同的人，两人的工作经历，学历、工作能力都差不多，单位为了搞平衡，可能两人中，就有一个人是提拔为副科级领导，有一人就只能担任四级主任科员，这种案例在机关中也是存在的。但与副科级领导职务相比，晋升四级主任科员的人估计也不会那么舒服，虽然待遇上去了，但失落感还是存在的。
综上所述，乡科级副职或是四级主任科员都是享受乡科级副职待遇，但担任乡科级副职领导职务的人，除了经济待遇以外，还有政治待遇，还有领导指挥的权力；四级主任科员虽然经济待遇不吃亏，工作压力也没有那么大，但最终还是要接受副科级领导的指挥，心里落差比较大。如果有机会选择，多数人都会选择担任乡科级副职。
