清末浙江新军为第二十一镇，统制吕本元、肖星垣，下辖四十一协（协统杨善德）和四十二协（协统蔡成勋、刘询）。辛亥革命时各省新军响应革命并协同围攻南京守军。1912年，南京临时政府结束时，黄兴任南京留守，先后将驻在苏、皖、浙、闽的军队加以整顿。4月24日，浙江奉命成立第五军，下辖第六师及第二十五师（包括第四十九、五十两旅），朱瑞任军长兼第六师师长。8月由吕公望继任。11月23日，任命周凤岐为第五军参谋长。袁世凯为削弱南方革命力量，授意北京陆军部，以编制和军饷缺乏等理由，迫使黄兴裁南方各省军队。浙江第五军、第二十五师及第五十旅在这种情况下先后撤销，仅剩第六师和四十九旅。

第六师师长

朱瑞（1912.4.22.军长兼），浙江海盐人，南洋陆师学堂毕业，光复会成员，浙军创建者及领导人之一。1912年7月，他由江南陆师、保定速成学校毕业生组成的本土派拥护为浙江都督。二次革命后因其中立态度，引起袁世凯猜疑，转而积极支持袁。

吕公望（1912.8.8.任），浙江永康人，保定陆军速成学堂毕业，光复会成员，浙军头目。护国运动期间，他被公举为浙江督军，同时兼任省长，公开声讨袁世凯。但因受到北洋军阀干预，同时内讧时起，仅半年时间，便被迫辞职而去。

叶颂清（1914.7.22.任），浙江宁海人，南洋陆师学堂毕业，光复会成员，浙军头目，与朱瑞交好。护国运动期间，他支持反帝反袁，主张浙江独立，默许下属出面，驱逐朱瑞出浙。

参谋长

李炜章（1912.11.23.任）；潘国纲（1915.10.6.调)；施秉志（1915.10.6.任）

第十一旅旅长

吕公望（1912.8.10.兼）

张载阳（1912.9.2.任），浙江新昌人，浙江武备学堂毕业，浙军将领。1922年11月任浙江省长，辅佐卢永祥（皖系骨干）治理浙江。

叶焕华（1914.7.22.任），浙江青田人，南洋陆师学堂毕业，浙军将领。1917年11月，他为响应护法活动，与前浙江督军蒋尊簋，第十二旅旅长童保暄及顾琼洲、朱光斗等率先在宁波举旗独立，宣布“自主”，旋因童保暄出卖而失利。

第二十一团团长 傅其永（1914.8.26.任）

第二十二团团长 米伟良（1914.8.26.任）

第十二旅旅长

叶颂清（1912.9.23.任）

童保暄（1914.7.22.任），浙江宁海人，保定陆军速成学堂毕业，浙军将领。护国运动期间，他在劝说朱瑞失败后，于1916年4月发动兵变，逐走朱瑞；后又联合夏超迫使继任都督屈映光辞职，推吕公望为都督兼省长。

第二十三团团长 李全义（1914.8.26.任）

第二十四团团长 章祖衡（1914.8.26.任）

炮兵第六团（师直辖）团长张国威（1914.8.26.任）；谢祖康（1915.10.31.任）

第四十九旅旅长

颜迺斌（1912.9.23.任；10.25.撤）

周凤岐（1913.10.29.署），浙江长兴人，浙江武备学堂毕业，浙军将领。江浙战争爆发后，他与夏超等密谋驱卢迎孙，使孙传芳部得以长驱直入。此后获任第二师师长职。

第九十七团团长 叶绍基

第九十八团团长 汪镐基